More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1017 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1017  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.104786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  66.8 
 
 
255 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  65.87 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  65.87 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  65.59 
 
 
252 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1140  hypothetical protein  64 
 
 
251 aa  321  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.380224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4347  hypothetical protein  61.66 
 
 
254 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2125  hypothetical protein  60.87 
 
 
253 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0474393  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0542  hypothetical protein  56.68 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  47.22 
 
 
250 aa  229  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2132  hypothetical protein  57.32 
 
 
269 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.43771  normal  0.384198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  45.27 
 
 
242 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  44 
 
 
250 aa  222  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  44.27 
 
 
253 aa  221  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  45.9 
 
 
252 aa  219  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  43.25 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  44.67 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  44.44 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  45.63 
 
 
248 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  45.63 
 
 
248 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  43.92 
 
 
252 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  44.44 
 
 
246 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  45.85 
 
 
248 aa  215  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.27 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  44.22 
 
 
249 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  44.44 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  42.63 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  44.05 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  44 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  43.25 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.86 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  43.65 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  44.72 
 
 
250 aa  211  9e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  44.49 
 
 
249 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  46.61 
 
 
246 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  42.46 
 
 
248 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  43.2 
 
 
248 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.65 
 
 
248 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  42.02 
 
 
255 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  42.29 
 
 
251 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  42.08 
 
 
242 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  44 
 
 
248 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  43.5 
 
 
249 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  42.8 
 
 
246 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  43.6 
 
 
248 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.91 
 
 
247 aa  208  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  42.4 
 
 
248 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  42.63 
 
 
250 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  42.62 
 
 
248 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  43.6 
 
 
248 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05381  hypothetical protein  56.6 
 
 
248 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  43.6 
 
 
248 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  44 
 
 
248 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  47.43 
 
 
253 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  42.23 
 
 
248 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.37 
 
 
247 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  42.8 
 
 
249 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40.96 
 
 
247 aa  204  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  43.48 
 
 
252 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  42 
 
 
249 aa  203  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  44.84 
 
 
250 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  44.84 
 
 
250 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  40.98 
 
 
247 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  42.13 
 
 
250 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  42.8 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  42.13 
 
 
250 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  41.9 
 
 
250 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.08 
 
 
247 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  42 
 
 
248 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.7 
 
 
246 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  43.43 
 
 
248 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  43.43 
 
 
248 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  43.43 
 
 
248 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  46.27 
 
 
252 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  41.15 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  43.48 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  41.83 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  43.25 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.16 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  40.87 
 
 
250 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  42.23 
 
 
248 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  43.08 
 
 
248 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  44.22 
 
 
249 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  41.83 
 
 
250 aa  199  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  43.08 
 
 
248 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  43.08 
 
 
248 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  44.72 
 
 
249 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  43.08 
 
 
248 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  42.8 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  39.34 
 
 
247 aa  198  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  42.69 
 
 
248 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  42.69 
 
 
248 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  42.02 
 
 
254 aa  198  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  43.08 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  41.6 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  45.24 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  43.43 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  43.82 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  41.5 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  41.83 
 
 
247 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>