More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0542 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0542  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108805  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2132  hypothetical protein  79.03 
 
 
269 aa  357  7e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.43771  normal  0.384198 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05381  hypothetical protein  65.59 
 
 
248 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  54.66 
 
 
252 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1140  hypothetical protein  54.25 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.380224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  53.2 
 
 
255 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4347  hypothetical protein  54.22 
 
 
254 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  52.4 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  52.4 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2125  hypothetical protein  52.42 
 
 
253 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0474393  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1017  hypothetical protein  56.68 
 
 
253 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.104786  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  45.68 
 
 
249 aa  215  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  44.53 
 
 
252 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  42.56 
 
 
251 aa  201  8e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  45.42 
 
 
247 aa  201  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  46.91 
 
 
246 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  47.11 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  45.45 
 
 
248 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  43.8 
 
 
250 aa  198  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  44.63 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  43.32 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  44.53 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  39.2 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  42 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  43.04 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  44.63 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  43.9 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  45.49 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  45.12 
 
 
248 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  42.8 
 
 
255 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  42.17 
 
 
255 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  44.26 
 
 
249 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  44.72 
 
 
248 aa  192  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.98 
 
 
247 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  42.91 
 
 
253 aa  192  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  45.75 
 
 
243 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  41.67 
 
 
242 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  44.44 
 
 
252 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  40.16 
 
 
250 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  44.63 
 
 
248 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  43.21 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  44.21 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  41.46 
 
 
247 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  44.18 
 
 
251 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  45.04 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1471  hypothetical protein  42.29 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  45.27 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  42.97 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  40.49 
 
 
247 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  40.82 
 
 
250 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  44.71 
 
 
246 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  43.8 
 
 
248 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  43.67 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  40.82 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  43.72 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.39 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  42.98 
 
 
249 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.22 
 
 
247 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  44.67 
 
 
252 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  41.32 
 
 
250 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  45.93 
 
 
250 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  42.68 
 
 
247 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  42.4 
 
 
249 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  41.98 
 
 
242 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  39.67 
 
 
250 aa  186  4e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  40.89 
 
 
249 aa  185  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  44.86 
 
 
248 aa  185  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  43.03 
 
 
248 aa  184  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  43.72 
 
 
243 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  44.18 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  44.31 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  44.18 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  42.28 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  43.8 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  40.41 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  40.91 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  41.56 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.98 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  41.87 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  42.56 
 
 
248 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  43.85 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  41.32 
 
 
247 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  41.27 
 
 
252 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  41.32 
 
 
247 aa  181  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  41.74 
 
 
252 aa  181  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  42.15 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  43.51 
 
 
244 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  44.31 
 
 
250 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  43.51 
 
 
244 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.74 
 
 
248 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.74 
 
 
248 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  44.44 
 
 
248 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  41.63 
 
 
251 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  41.74 
 
 
249 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  42.32 
 
 
245 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  41.32 
 
 
248 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  43.5 
 
 
248 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>