More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3779 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3779  ABC transporter related  100 
 
 		 516 aa  988    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  44.97 
 
 		 543 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  45.16 
 
 		 544 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 544 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2126  ABC transporter related  44.8 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  44.99 
 
 		 540 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 		 559 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  44.51 
 
 		 531 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  44.99 
 
 		 540 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  47.55 
 
 		 543 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  45.09 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  44.82 
 
 		 555 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  44.91 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  44.61 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  44.91 
 
 		 544 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  43.5 
 
 		 533 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  44.31 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  43.86 
 
 		 540 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  43.86 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  44.26 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2143  ABC transporter-related protein  44.17 
 
 		 549 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  45.2 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1813  ABC transporter related  44.82 
 
 		 545 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.22 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  41.76 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.54 
 
 		 620 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  43.16 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  42.91 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  44.29 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.97 
 
 		 543 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  46.82 
 
 		 527 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.75 
 
 		 534 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.57 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  43.86 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  43.86 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1017  ABC transporter related  45.4 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0546481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  44.68 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  43.13 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  44.78 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  45.06 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  44.34 
 
 		 543 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1915  ABC transporter related  44.26 
 
 		 545 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.57 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1176  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000161898  normal  0.341996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.21 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  45.42 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3465  ABC transporter related  44.78 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1949  ABC transporter related  46.14 
 
 		 531 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.267995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2976  ABC transporter related  44.57 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1111  ABC transporter related  45.21 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.778341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1913  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 530 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  45.77 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2339  ABC transporter related  43.27 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.26 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  43.82 
 
 		 542 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.06 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  42.5 
 
 		 539 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.23 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  42.2 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  40.96 
 
 		 599 aa  364  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  43.42 
 
 		 545 aa  364  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0594  ABC transporter related  46.29 
 
 		 530 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  43.42 
 
 		 545 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  42.86 
 
 		 557 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 544 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.24 
 
 		 564 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  45.23 
 
 		 550 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.28 
 
 		 592 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  40.46 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.31 
 
 		 534 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  39.07 
 
 		 566 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  44.14 
 
 		 537 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  39.61 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  40.11 
 
 		 588 aa  361  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  44.4 
 
 		 619 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.96 
 
 		 613 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  41.63 
 
 		 556 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  42.72 
 
 		 542 aa  360  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  43.92 
 
 		 542 aa  360  5e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  38.35 
 
 		 543 aa  360  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  41.75 
 
 		 541 aa  359  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2329  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 529 aa  359  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.787685  normal  0.0242694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2459  glutathione import ATP-binding protein GsiA  41.95 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.798953 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  42.67 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.31 
 
 		 615 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2423  ABC transporter related  42.67 
 
 		 563 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00102758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>