196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1074 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1074  L-threonine aldolase  100 
 
 		 356 aa  710    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2895  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285403  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04270  threonine aldolase  40.06 
 
 		 381 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2254  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.31 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0700219 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50097  predicted protein  31.88 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3880  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.44 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3317  Threonine aldolase  32.21 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0449  Threonine aldolase  29.87 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078963  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74130  threonine aldolase  28.46 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3740  threonine aldolase  35.25 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6238  Threonine aldolase  27.82 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3094  L-threonine aldolase  32.67 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1729  Threonine aldolase  31.1 
 
 		 343 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.446616  normal  0.527107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1115  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  35.46 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4651  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.58 
 
 		 347 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.542554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5114  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.44 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1386  L-threonine aldolase  30.68 
 
 		 333 aa  92.8  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71203  threonine aldolase  29.17 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49372  predicted protein  28.68 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3700  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.11 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0206  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.92 
 
 		 345 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2609  Threonine aldolase  32.52 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1771  L-allo-threonine aldolase  29.9 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.444188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1125  L-allo-threonine aldolase  29.9 
 
 		 397 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.628839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2826  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.87 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5192  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.89 
 
 		 348 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2053  Threonine aldolase  32.36 
 
 		 349 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0430  low-specificity L-threonine aldolase  29.97 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0337  low-specificity L-threonine aldolase  29.97 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.400783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2098  L-allo-threonine aldolase  29.9 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1834  L-allo-threonine aldolase  29.97 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0852562  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0834  L-allo-threonine aldolase  29.97 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0108221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0178  L-threonine aldolase  29.33 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1588  L-threonine aldolase  31.06 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2705  L-threonine aldolase  31.06 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1032  L-threonine aldolase  30.54 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2147  L-allo-threonine aldolase  29.64 
 
 		 461 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0934  L-threonine aldolase  30.54 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1051  L-threonine aldolase  30.54 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0969  L-threonine aldolase  30.54 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2461  L-threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.994155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1001  L-threonine aldolase  30.54 
 
 		 333 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.13566  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00875  L-allo-threonine aldolase, PLP-dependent  28.4 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.533076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2772  Threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.826971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00881  hypothetical protein  28.4 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.554159  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1081  threonine aldolase  27.31 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1031  L-threonine aldolase  28.8 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0899  L-threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.859325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2726  L-threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2168  Threonine aldolase  28.93 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0943  L-threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.59  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4745  Threonine aldolase  29.64 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1039  threonine aldolase  27.31 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2620  L-threonine aldolase  31.06 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0974  L-threonine aldolase  28.4 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1764  threonine aldolase  32.94 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382651  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5386  threonine aldolase  28.01 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5364  threonine aldolase  30 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5475  threonine aldolase  28.01 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19940  threonine aldolase  26.83 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3310  threonine aldolase  29 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.124779  normal  0.12149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1602  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.7 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4076  threonine aldolase  31.25 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000453005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4499  Threonine aldolase  34.51 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5037  Threonine aldolase  32.4 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.258099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0699  threonine aldolase  28.94 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4794  threonine aldolase  28.81 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4817  threonine aldolase  30.92 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5390  putative L-allo-threonine aldolase  30.52 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.891866  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1776  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.63 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1535  Threonine aldolase  32.29 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.619548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3482  threonine aldolase  31.54 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.022519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2554  threonine aldolase  28.52 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3557  threonine aldolase  30.42 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0270  L-threonine aldolase  31.54 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2205  threonine aldolase  28.62 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1663  L-threonine aldolase  28.29 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.469796  normal  0.726429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08076  L-allo-threonine aldolase  26.59 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00986668  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33121  predicted protein  27.54 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.752316  normal  0.13405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0734  threonine aldolase  29.52 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2367  L-threonine aldolase  25.28 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2204  L-threonine aldolase  30.74 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3480  Threonine aldolase  30.43 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000277913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6047  Threonine aldolase  29.52 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3290  Threonine aldolase  27.34 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170768 
 
 
-
 
NC_002978  WD0618  L-allo-threonine aldolase, putative  26.82 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164351  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04680  threonine aldolase, putative  27.88 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1841  threonine aldolase, low-specificity  29.45 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1036  threonine aldolase  27.46 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0105  threonine aldolase  28.87 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0310789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0544  L-threonine aldolase  26.67 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.697655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0228  Threonine aldolase  27.03 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1282  Threonine aldolase  30.09 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2345  threonine aldolase  29.03 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5734  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  34.48 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5968  Threonine aldolase  30.45 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.904259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0009  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  32.13 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2159  Beta-eliminating lyase  32.05 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2851  L-threonine aldolase  31.15 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2023  L-allo-threonine aldolase  32.05 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>