78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  100 
 
 		 461 aa  883    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  60.22 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.27 
 
 		 436 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  44.18 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.6 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.79 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  43.01 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.98 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.98 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.14 
 
 		 440 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  42.01 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.83 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.86 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.52 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.23 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.23 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  43.64 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.39 
 
 		 453 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.98 
 
 		 434 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.01 
 
 		 432 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  43.79 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.79 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.82 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  38.43 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  37.99 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  38.21 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  37.99 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  38.21 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  38.21 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.53 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  37.77 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  37.55 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  37.55 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.99 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.3 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.78 
 
 		 435 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.08 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  37.69 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  37.25 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  38.56 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.56 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.96 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.99 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.7 
 
 		 494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.43 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  39.3 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  39.3 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.3 
 
 		 433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  38.78 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.89 
 
 		 443 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  37.89 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  37.96 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.08 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.91 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
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NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  37.74 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.3 
 
 		 443 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  42.11 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  37.37 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.04 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  37.96 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.26 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  35.01 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.26 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.43 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.15 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.86 
 
 		 438 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.21 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.79 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.79 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  35.36 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.92 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.99 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  33.5 
 
 		 448 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.5 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3979  low affinity gluconate transporter  30.69 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4088  low affinity gluconate transporter  30.69 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4175  low affinity gluconate transporter  30.69 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4057  low affinity gluconate transporter  30.69 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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