75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4146 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 431 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  50.91 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  51.14 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  50.91 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  50.68 
 
 		 434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  50.91 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  50.45 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  50.45 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  50.45 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  50.45 
 
 		 434 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  52.4 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  50.91 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.61 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  49.04 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  48.8 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  45.03 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  45.03 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.5 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  46.5 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.03 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.27 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  45.03 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.47 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  45.27 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.58 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  46.58 
 
 		 434 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.5 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.58 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.08 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  44.95 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  45.7 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  44.27 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.55 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  42.69 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.01 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.44 
 
 		 432 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  41.23 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.98 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.74 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.74 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  40.23 
 
 		 430 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.51 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.28 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.51 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  40.51 
 
 		 432 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.28 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  40.28 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.93 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.93 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.14 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.05 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.05 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.47 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.22 
 
 		 438 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.44 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  39.44 
 
 		 433 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  39.68 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.81 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.14 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.37 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.54 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.95 
 
 		 435 aa  315  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  38.38 
 
 		 461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.27 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.17 
 
 		 478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.13 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.75 
 
 		 454 aa  285  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.57 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  35.68 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.09 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  30.42 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.11 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.11 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.41 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4120  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.92 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141301  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>