74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2489 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 478 aa  918    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  42.95 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.37 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.76 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  42.74 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.11 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.11 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  42.52 
 
 		 434 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  43.1 
 
 		 434 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  41.54 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  42.3 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  41.13 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  41.34 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  41.34 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  42.67 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  42.08 
 
 		 434 aa  360  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.45 
 
 		 437 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.58 
 
 		 443 aa  355  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  42.58 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.24 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  41.98 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  41.77 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  42.62 
 
 		 435 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.49 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.8 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.98 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.32 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.45 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.7 
 
 		 478 aa  283  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.18 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.94 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  31.93 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  31.93 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.7 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  31.09 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.51 
 
 		 453 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  31.09 
 
 		 440 aa  224  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  31.51 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.51 
 
 		 432 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  30.63 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.22 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.22 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.36 
 
 		 434 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  29.63 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.09 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.09 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.09 
 
 		 432 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  30.88 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.88 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  31.65 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.22 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  32.77 
 
 		 461 aa  200  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  50 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  47.91 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  51.47 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.51 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  49.51 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.51 
 
 		 435 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  50 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  50 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  31.45 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.41 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  29.52 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  24.95 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  24.95 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  27.99 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  38.24 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  24.7 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.33 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  36.27 
 
 		 432 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.82 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  33.82 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.3 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  32.8 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
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