74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1244 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 432 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  98.84 
 
 		 432 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  91.67 
 
 		 432 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  90.05 
 
 		 434 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  92.82 
 
 		 434 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  97.69 
 
 		 432 aa  828    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  98.38 
 
 		 432 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 432 aa  846    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  98.38 
 
 		 432 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  73.68 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  70.73 
 
 		 453 aa  617  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  72.25 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.14 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.14 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  64.43 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  65.74 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.36 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.13 
 
 		 433 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  64.2 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  60.54 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  60.46 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.74 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.97 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  63.97 
 
 		 433 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.95 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.95 
 
 		 440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  62.12 
 
 		 433 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.54 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.74 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  40.95 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  40.72 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  40.95 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  40.5 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  40.5 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  40.5 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.62 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.98 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  40.98 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  40.27 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  43.42 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  40.27 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  40.27 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.72 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  38.27 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  38.5 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  41.07 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  39 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  38.76 
 
 		 434 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.92 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.36 
 
 		 435 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  37.13 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.13 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  38.44 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.57 
 
 		 454 aa  306  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.48 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  38.72 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.73 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  39.07 
 
 		 434 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.81 
 
 		 434 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  39.27 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.99 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.05 
 
 		 437 aa  282  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.67 
 
 		 443 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.41 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.29 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  37.79 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.81 
 
 		 482 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.85 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.85 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  29.27 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.33 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.36 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.89 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.27 
 
 		 478 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>