74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3166 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  97.95 
 
 		 440 aa  853    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 440 aa  869    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  61.76 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  60.59 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  59.91 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  59.91 
 
 		 432 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  58.6 
 
 		 434 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.86 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  59.5 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.64 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  60.49 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.5 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.18 
 
 		 432 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.95 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.95 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.95 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  57.95 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  57.73 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.92 
 
 		 434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  57.99 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  58.41 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  59.23 
 
 		 442 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.18 
 
 		 433 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.64 
 
 		 433 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  58.64 
 
 		 433 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  57.27 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.64 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.86 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.01 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  40.45 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  40.22 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.39 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  40.86 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  42.46 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.94 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  41.93 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.83 
 
 		 435 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  41.93 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  41.7 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  41.48 
 
 		 434 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.72 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  40.72 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.23 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  41.03 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  42.36 
 
 		 461 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  41.03 
 
 		 434 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  41.48 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  41.48 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  40.81 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  42.22 
 
 		 442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.36 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  41.26 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  40.84 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  39.81 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  39.81 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.13 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.81 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.9 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.55 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  40.14 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.6 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  39 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.93 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.28 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.08 
 
 		 478 aa  282  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.91 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.55 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.89 
 
 		 488 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.84 
 
 		 499 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.75 
 
 		 456 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.75 
 
 		 456 aa  256  6e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  35.03 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  31.87 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.31 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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