76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3361 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  83.3 
 
 		 443 aa  731    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  83.3 
 
 		 443 aa  728    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  83.67 
 
 		 442 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 443 aa  877    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.14 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.91 
 
 		 435 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  66.14 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  65.68 
 
 		 435 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  65.68 
 
 		 435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  64.55 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.82 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  64.77 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  63.72 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  66.36 
 
 		 435 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  61.36 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  61.14 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  61.14 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  61.14 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  60.68 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  61.14 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  61.14 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  60.91 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  61.14 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  60.91 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  61.14 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.63 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  51.95 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  51.25 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  51.48 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  51.25 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  51.52 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  52.5 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.54 
 
 		 478 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.73 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.54 
 
 		 488 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.61 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.68 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  44.05 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.67 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  43.12 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.39 
 
 		 440 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.15 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.39 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.57 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.57 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  40.67 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.96 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.62 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.62 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.67 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.45 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  40.4 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.4 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.96 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  39.73 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.73 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.6 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  40.9 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.67 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  40.27 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  40.22 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.27 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.29 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.11 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.94 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.95 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.13 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  36.24 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  35.37 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.6 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.6 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.95 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  50.49 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  29.42 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  29.33 
 
 		 609 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  29.81 
 
 		 609 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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