81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2672 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  100 
 
 		 430 aa  842    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  72.03 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  72.03 
 
 		 432 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  67.9 
 
 		 433 aa  584  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  66.82 
 
 		 433 aa  585  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  67.67 
 
 		 433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  66.44 
 
 		 434 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.67 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  66.67 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.74 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.05 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.2 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.2 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.74 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  66.2 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  64.68 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.06 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  66.97 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  65.6 
 
 		 438 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.97 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  66.82 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.82 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.3 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  66.36 
 
 		 433 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  61.43 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  58.22 
 
 		 440 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.99 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.05 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.12 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.23 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  42.76 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.76 
 
 		 443 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  43.52 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  41.97 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  43.72 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  41.74 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.83 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  41.69 
 
 		 434 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  41.45 
 
 		 434 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  41.23 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.6 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  41 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  41.23 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  40.6 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  40.96 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.11 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  41 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.88 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  41.31 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  40.77 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  41 
 
 		 434 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  41.65 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  40.77 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  40.77 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  40.65 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.65 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.06 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.23 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.2 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  40.83 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.23 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.48 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.94 
 
 		 494 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.33 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.25 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.12 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.9 
 
 		 436 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.21 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.46 
 
 		 499 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  37.07 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.68 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.68 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  33.42 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.24 
 
 		 478 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2859  gluconate transporter  25.45 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2638  gluconate transporter  25.45 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2727  gluconate transporter  25.45 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2686  gluconate transporter  25.45 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  23.27 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  22.91 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  22.91 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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