74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  100 
 
 		 435 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  41.45 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.94 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.94 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.2 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.64 
 
 		 454 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.84 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  35.93 
 
 		 434 aa  274  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.47 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.41 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  35.48 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  37.07 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.68 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  35.7 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.93 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  35.24 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  35.47 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  35.7 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  34.56 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.26 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  37.79 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  35.17 
 
 		 435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.7 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.03 
 
 		 432 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  38.03 
 
 		 432 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  34.37 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.79 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.79 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  35.47 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  35.47 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  35.4 
 
 		 435 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.37 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.07 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.07 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.99 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.21 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.88 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  35.88 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.88 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.18 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.03 
 
 		 440 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.31 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  36.07 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.71 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.03 
 
 		 440 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.77 
 
 		 434 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.41 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.91 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.71 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  35.96 
 
 		 435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  36.49 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  35 
 
 		 434 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  34.67 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.8 
 
 		 453 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  35 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  36.14 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  34.77 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.24 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  34.86 
 
 		 434 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.78 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
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NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  34.62 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  36.18 
 
 		 433 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.18 
 
 		 433 aa  249  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  35.21 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  34.92 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.65 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.4 
 
 		 494 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.33 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.7 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
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NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.57 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.67 
 
 		 499 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.93 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
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NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.67 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.8 
 
 		 478 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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