74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1037 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 499 aa  979    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  54.96 
 
 		 494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  54.67 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  51.98 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  50.49 
 
 		 478 aa  438  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.18 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  44.58 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  44.78 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.33 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.53 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.3 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  44.33 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  45.88 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  46.09 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.53 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  44.72 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  44.72 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  44.09 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  41.97 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.65 
 
 		 437 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.76 
 
 		 434 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.07 
 
 		 438 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  40.56 
 
 		 434 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.16 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  39.76 
 
 		 434 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.96 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.61 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.56 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.57 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.42 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.31 
 
 		 440 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  35.86 
 
 		 430 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.79 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.06 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.06 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.58 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.72 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  33.07 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.91 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.91 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  34.72 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.26 
 
 		 435 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  47.3 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  47.3 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  46.47 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  46.89 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  46.47 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  46.89 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  46.47 
 
 		 434 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  46.06 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  46.06 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.89 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  33.67 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.44 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.65 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.65 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  27.47 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  41.9 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  42.65 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.65 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.33 
 
 		 432 aa  160  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.18 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.38 
 
 		 432 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.23 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.73 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  44.29 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.05 
 
 		 453 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  44.22 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  36.89 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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