74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1367 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  89.35 
 
 		 434 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  98.38 
 
 		 432 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  99.54 
 
 		 432 aa  841    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  92.13 
 
 		 432 aa  784    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  92.13 
 
 		 434 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  97.92 
 
 		 432 aa  830    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 432 aa  844    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  98.38 
 
 		 432 aa  835    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  100 
 
 		 432 aa  844    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  73.91 
 
 		 438 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  72.25 
 
 		 438 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  70.51 
 
 		 453 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.07 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.07 
 
 		 432 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  66.2 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  63.97 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.59 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.36 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  64.43 
 
 		 433 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  60.69 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.97 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  64.2 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.2 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.95 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  59.64 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.95 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  62.59 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.77 
 
 		 436 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.51 
 
 		 431 aa  349  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  40.5 
 
 		 434 aa  333  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  40.27 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  40.05 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  40.5 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  40.05 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.98 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  40.98 
 
 		 443 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  40.05 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.73 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  39.82 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  42.98 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  39.82 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  39.82 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.27 
 
 		 434 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  38.72 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  38.95 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  41.07 
 
 		 442 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  38.76 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  38.52 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.92 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.36 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.96 
 
 		 438 aa  305  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  37.13 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.13 
 
 		 435 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  38.22 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  42.35 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  39.18 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.27 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  38.6 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.36 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  39.04 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.53 
 
 		 434 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.05 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.21 
 
 		 443 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.18 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.5 
 
 		 478 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  38.03 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.81 
 
 		 482 aa  245  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.41 
 
 		 456 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.41 
 
 		 456 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  30.39 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.36 
 
 		 494 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.33 
 
 		 499 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.89 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.78 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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