74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4510 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  91.9 
 
 
432 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  97.69 
 
 
432 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  97.92 
 
 
432 aa  830    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  98.38 
 
 
432 aa  833    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  97.92 
 
 
432 aa  830    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  100 
 
 
432 aa  844    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  92.13 
 
 
434 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  97.69 
 
 
432 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  89.35 
 
 
434 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  72.44 
 
 
438 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  72.02 
 
 
438 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  70.29 
 
 
453 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  69.91 
 
 
432 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  69.91 
 
 
432 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  66.67 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  63.59 
 
 
433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.59 
 
 
433 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.36 
 
 
433 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  64.43 
 
 
433 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  60.46 
 
 
435 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.97 
 
 
433 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  64.43 
 
 
433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.43 
 
 
433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.73 
 
 
440 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  59.41 
 
 
442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.34 
 
 
440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  62.59 
 
 
433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.54 
 
 
436 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.28 
 
 
431 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  40.72 
 
 
434 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  40.5 
 
 
434 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  40.27 
 
 
434 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  40.75 
 
 
443 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.75 
 
 
443 aa  332  9e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  43.42 
 
 
461 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.4 
 
 
443 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  40.27 
 
 
434 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  40.27 
 
 
434 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  39.82 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  40.05 
 
 
434 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  39.59 
 
 
434 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  39.59 
 
 
434 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.5 
 
 
434 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  38.5 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  38.72 
 
 
435 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  39 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  40.45 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  38.76 
 
 
434 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.78 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.33 
 
 
435 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  37.1 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.1 
 
 
435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.48 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  37.78 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.91 
 
 
454 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  38.95 
 
 
435 aa  302  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.73 
 
 
434 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  39.3 
 
 
434 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.81 
 
 
434 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  39.27 
 
 
434 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.44 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.82 
 
 
437 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.86 
 
 
436 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.44 
 
 
443 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  37.79 
 
 
435 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.58 
 
 
482 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.89 
 
 
478 aa  246  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.08 
 
 
456 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.08 
 
 
456 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  29.27 
 
 
448 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.63 
 
 
494 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.33 
 
 
499 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.19 
 
 
488 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.27 
 
 
478 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>