76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1226 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 
436 aa  849    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  52.4 
 
 
431 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  50.69 
 
 
432 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.32 
 
 
434 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.86 
 
 
440 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.86 
 
 
440 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  50.68 
 
 
434 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  49.54 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.97 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  50 
 
 
432 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.77 
 
 
432 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  49.77 
 
 
432 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.54 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.54 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  49.54 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  46.99 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.62 
 
 
432 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.62 
 
 
432 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.47 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  48.05 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  46.4 
 
 
434 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  46.4 
 
 
434 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  46.4 
 
 
434 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  46.62 
 
 
434 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  46.4 
 
 
434 aa  395  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  45.95 
 
 
434 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  45.95 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  44.14 
 
 
435 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  43.91 
 
 
435 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  45.95 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  45.72 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  45.89 
 
 
442 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.22 
 
 
435 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  44.83 
 
 
435 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.83 
 
 
435 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.17 
 
 
434 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.83 
 
 
435 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.17 
 
 
433 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.94 
 
 
433 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  44.34 
 
 
434 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.29 
 
 
435 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  43.87 
 
 
434 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  48.62 
 
 
433 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.48 
 
 
433 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  43.22 
 
 
435 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  43.67 
 
 
443 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.69 
 
 
433 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.69 
 
 
443 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  47.69 
 
 
433 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  45.05 
 
 
461 aa  367  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.61 
 
 
433 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  43.46 
 
 
443 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  41.04 
 
 
443 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.19 
 
 
434 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  43.65 
 
 
442 aa  350  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.09 
 
 
434 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  43.74 
 
 
434 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  43.18 
 
 
434 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.51 
 
 
434 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.01 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.56 
 
 
494 aa  336  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.65 
 
 
443 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40 
 
 
488 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.41 
 
 
454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.83 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.87 
 
 
478 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.42 
 
 
436 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  33.77 
 
 
448 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  36.18 
 
 
435 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.61 
 
 
456 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.61 
 
 
456 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.79 
 
 
499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.75 
 
 
478 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2511  Citrate transporter  31.62 
 
 
447 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0263048 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  24.29 
 
 
442 aa  43.5  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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