74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4787 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 482 aa  938    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  67.01 
 
 		 478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  59.96 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  59.79 
 
 		 488 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  51.51 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.78 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  45.85 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  45.64 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.77 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.74 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  46.55 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  45.74 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.74 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  46.04 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  46.04 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  45.32 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.74 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  44.49 
 
 		 443 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  45.32 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  45.23 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  42.62 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  42.62 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  43.04 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  42.62 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  41.79 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  42.2 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  42.2 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  42.2 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  41.58 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  42.2 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.17 
 
 		 434 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
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NC_002947  PP_2057  citrate transporter  40.37 
 
 		 434 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.37 
 
 		 434 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  41.42 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.37 
 
 		 434 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  39.54 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.2 
 
 		 438 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.92 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  39 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.93 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.51 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  35.54 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  35.12 
 
 		 430 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.97 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
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NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.75 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.16 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.16 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  37.18 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
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NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.02 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.98 
 
 		 453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.3 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.47 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.68 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  35.68 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.07 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.2 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.43 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
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NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.23 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  32.71 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  34.58 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.81 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.26 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.81 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.02 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  34.93 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.61 
 
 		 434 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  33.81 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.81 
 
 		 432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.33 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  34.57 
 
 		 435 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.12 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  30.12 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  26.5 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.41 
 
 		 478 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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