77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6324 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  93.09 
 
 		 434 aa  807    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  89.35 
 
 		 432 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  90.05 
 
 		 432 aa  778    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  89.35 
 
 		 432 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  85.88 
 
 		 432 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  89.35 
 
 		 432 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 434 aa  856    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  90.05 
 
 		 432 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  89.81 
 
 		 432 aa  776    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  72.6 
 
 		 438 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  71.46 
 
 		 438 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  70.2 
 
 		 453 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.14 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  70.14 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  65.05 
 
 		 430 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  63.97 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.68 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.45 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  62.99 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  62.99 
 
 		 433 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  59.59 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  62.76 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  62.76 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  58.81 
 
 		 435 aa  527  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  61.15 
 
 		 433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  58.14 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  57.92 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  49.32 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.28 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  40.41 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  40.18 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  40.64 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  40.18 
 
 		 434 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  39.95 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  40.18 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  40.18 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.94 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  40.94 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  41.96 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  39.95 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  39.95 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.41 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.6 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  38.44 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  38.67 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  39.42 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  39.18 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  39.6 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.59 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  37.36 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.36 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.04 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  38.44 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  38.95 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.41 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.43 
 
 		 438 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.37 
 
 		 434 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.92 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.98 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  37.95 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  37.92 
 
 		 434 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.76 
 
 		 494 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.43 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.1 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.32 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.55 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.81 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  37.47 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.23 
 
 		 482 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.19 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  33.19 
 
 		 456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  30.38 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.67 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.78 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0774  hypothetical protein  24.55 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0780  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.95 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.222302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1715  Gluconate transporter  31.25 
 
 		 496 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>