74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1576 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  95.85 
 
 		 434 aa  828    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  96.08 
 
 		 434 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  90.09 
 
 		 434 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 434 aa  855    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  94.7 
 
 		 434 aa  817    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  54.46 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  54.23 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  53.99 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  54.21 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  54.46 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  54 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  53.99 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  54.46 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  53.99 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  54.92 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  51.48 
 
 		 443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  51.72 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  51.95 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  50.81 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  51.04 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  51.04 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  53.07 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  53.07 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  52.17 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  50.93 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  51.08 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  51.08 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  51.03 
 
 		 435 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  50.58 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  48.97 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.47 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.96 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.27 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.19 
 
 		 436 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.71 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
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NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  41.88 
 
 		 430 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.17 
 
 		 482 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.9 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.13 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.14 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.14 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.2 
 
 		 478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  39.82 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  38.13 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.13 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.86 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.9 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.46 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.94 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  38.94 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.81 
 
 		 432 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.81 
 
 		 432 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  39.36 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.92 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.44 
 
 		 435 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.9 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  38.81 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  38.89 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.58 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  38.36 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.36 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.29 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.94 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.09 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  34.92 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.68 
 
 		 454 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  35.24 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.05 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  50.49 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  48.57 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.78 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  31.78 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  47.73 
 
 		 499 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  29.56 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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