75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1349 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  100 
 
 		 478 aa  918    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  67.54 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  59.68 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  60 
 
 		 488 aa  541  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  49.06 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  48.12 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  47.49 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.9 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  51.57 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  47.28 
 
 		 435 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  46.54 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.54 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  46.33 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  47.38 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  46.87 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  46.65 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.38 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  46.44 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  44.44 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  44.44 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  44.65 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  44.86 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  44.65 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  46.54 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  44.44 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  44.23 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  44.23 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  45.07 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  44.23 
 
 		 443 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  44.73 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  41.82 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.12 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.41 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.2 
 
 		 434 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.83 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  38.41 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  38 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.97 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.53 
 
 		 440 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.91 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.85 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.85 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  36.23 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.34 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  35.83 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.12 
 
 		 438 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.34 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.31 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.26 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.34 
 
 		 432 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.31 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.09 
 
 		 438 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  36.72 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  33.82 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.93 
 
 		 434 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  35.14 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.1 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.34 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.93 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  34.93 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  35.14 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.14 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  35.4 
 
 		 433 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.4 
 
 		 433 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  35.55 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  35.4 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.53 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.98 
 
 		 436 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  33.96 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  29.92 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  29.92 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  25.89 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  50.33 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>