75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1640 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1574  CitMHS family citrate/H+ symporter  95.15 
 
 		 433 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0220323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1566  CitMHS family citrate/H+ symporter  96.77 
 
 		 433 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336157  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1187  citrate transporter  99.31 
 
 		 433 aa  831    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1667  CitMHS family citrate/H+ symporter  99.31 
 
 		 433 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1585  CitMHS family citrate/H+ symporter  97.23 
 
 		 433 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145337  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4815  citrate transporter  96.54 
 
 		 433 aa  789    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1640  CitMHS family citrate/H+ symporter  100 
 
 		 433 aa  836    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0896297  normal  0.0750285 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3734  citrate/H+ symporter, CitMHS family  69.05 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4811  citrate/H+ symporter, CitMHS family  69.05 
 
 		 432 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2672  citrate transporter  66.97 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3690  citrate/H+ symporter, CitMHS family  67.12 
 
 		 438 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5611  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.12 
 
 		 453 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1475  citrate transporter  64.9 
 
 		 433 aa  554  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4049  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.53 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6324  CitMHS family citrate/H+ symporter  63.68 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4090  citrate/H+ symporter, CitMHS family  64.6 
 
 		 434 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1345  CitMHS family citrate/H+ symporter  65.13 
 
 		 432 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0498159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1367  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.67 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1929  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.67 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0252426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0885  citrate transporter  64.67 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0826  citrate transporter  64.38 
 
 		 442 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.573841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4510  citrate transporter  64.67 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1244  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.43 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1270  CitMHS family citrate/H+ symporter  64.43 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3166  citrate/H+ symporter, CitMHS family  58.18 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00765485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1165  citrate/H+ symporter, CitMHS family  59.09 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0312297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3293  CitMHS family citrate/H+ symporter  60.5 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1226  CitMHS family citrate/H+ symporter  47.48 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4146  citrate/H+ symporter, CitMHS family  39.81 
 
 		 431 aa  339  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3361  citrate/H+ symporter, CitMHS family  40.67 
 
 		 443 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0198  citrate transporter  39.46 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0062  citrate transporter  39.23 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0284  Mg++/citrate complex transporter  39.15 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0255  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.6 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02410  Mg++/citrate complex transporter  39.78 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0163  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.32 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0147  citrate transporter  39.09 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0752628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0165  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.09 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72170  putative citrate transporter  40.53 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.548701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6266  putative citrate transporter  40.53 
 
 		 434 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.900336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0690  citrate transporter, CitM family  40.09 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0472  citrate transporter  39.86 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0622  citrate transporter  40.09 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0617  citrate transporter, CitM family  40.09 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0597  citrate transporter, CitM family  40.09 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0473  citrate transporter  39.86 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4742  citrate transporter, CitM family  40.09 
 
 		 434 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49590  Citrate transporter  39.45 
 
 		 443 aa  312  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0474  CitMHS family citrate/H+ symporter  40.32 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0561  citrate transporter  39.64 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0530  citrate transporter  39.64 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0485  CitMHS family citrate/H+ symporter  43.94 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5080  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.32 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0152734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3161  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.36 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.665522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1576  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.9 
 
 		 434 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0156204  normal  0.440638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3665  citrate/H+ symporter, CitMHS family  41.19 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18490  citrate transporter, CitMHS family  39.52 
 
 		 461 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0031  citrate transporter  38.46 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.733662  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2057  citrate transporter  38.44 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0106453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3683  CitMHS family citrate/H+ symporter  38.44 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1271  citrate transporter  38.44 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1382  citrate/H+ symporter, CitMHS family  37.9 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1305  CitMHS family citrate/H+ symporter  36.5 
 
 		 494 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4787  citrate/H+ symporter, CitMHS family  36.11 
 
 		 482 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1348  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.12 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0536  CitMHS family citrate/H+ symporter  37.3 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1525  CitMHS family citrate/H+ symporter  39.13 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0387485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1349  citrate/H+ symporter, CitMHS family  35.4 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17120  Citrate transporter  36.41 
 
 		 435 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1037  citrate/H+ symporter, CitMHS family  34.52 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2695  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.88 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2641  CitMHS family citrate/H+ symporter  32.88 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0235  citrate transporter, authentic frameshift  30.37 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2489  citrate/H+ symporter, CitMHS family  33.82 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  23.02 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>