43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  657    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  29.79 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  30.66 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  32.32 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  33.2 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  31.84 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  31.84 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  31.84 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  32.06 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  30.28 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  33.06 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.35 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.85 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  30.85 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  29.86 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  30.64 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  26.47 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  30.61 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  27.8 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30.08 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  27.64 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  37.65 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  28.75 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  29.18 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  27.24 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  29.68 
 
 		 278 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  25.88 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  34.06 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  33.33 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  30.97 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  32.17 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  37.08 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  27.4 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  26.79 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 800 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  26.37 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  26.76 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0226  hypothetical protein  36.76 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>