26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0352 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  40.72 
 
 
303 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  42.03 
 
 
310 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  40.75 
 
 
337 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  33.45 
 
 
290 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  35.42 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  35.16 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  36.82 
 
 
278 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  31.91 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  30.37 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  30.55 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.97 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
800 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  31.37 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  28.24 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  28.24 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  28.24 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3712  hypothetical protein  29.1 
 
 
297 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  27.04 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  26.42 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  28.36 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  27.05 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  27.05 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  27.05 
 
 
341 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  25.98 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>