33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7786 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  554  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  62.77 
 
 
278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  50.71 
 
 
290 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  45.53 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  39.85 
 
 
337 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  35.32 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  36.17 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  35.29 
 
 
310 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.61 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  29.15 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  27.13 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  30.33 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  30.33 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  30.33 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  30.33 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  31.11 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  31.51 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
800 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  45.74 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  29.58 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  24.9 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  27.23 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  29.58 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.09 
 
 
326 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  24.4 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  25.62 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  24.88 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  24.88 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  24.88 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.4 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  39.68 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  29.91 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  24.88 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>