28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3904 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  42.03 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  39.15 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  35.21 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  37.39 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  37.39 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  37.39 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  36.59 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  36.59 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  36.59 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  38.68 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  30.69 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  32.87 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  28.08 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  34.44 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  29.14 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  32.16 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  27.32 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  27.94 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  29.13 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  38.1 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  24.91 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  28.8 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  28.69 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  25.71 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  25.39 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>