37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1955 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  100 
 
 		 307 aa  594  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  38.27 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  32.59 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  31.72 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  32.32 
 
 		 335 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  31.01 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.09 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  31.51 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  29.86 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  29.51 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  34.53 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  33.5 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  29.27 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  27.45 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  29.65 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  27.8 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  29.58 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  29.58 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  29.58 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  29.51 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30.61 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.24 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  26.51 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  28.92 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.64 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.63 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  24.91 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  25.72 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  26.26 
 
 		 278 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  34.33 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  27.01 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  23.83 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  29.68 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0226  hypothetical protein  24.02 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>