31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1556 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  28.46 
 
 		 306 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  30.08 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  28.75 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  29.39 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  33.18 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  35.11 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  30.2 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  32.08 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  32.13 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  30.63 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.57 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  28 
 
 		 278 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  26.69 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  30.67 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  32.06 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  32.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  32.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  32.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  27.35 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  28.88 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  33.06 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  25.74 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30.54 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  29.72 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  30.28 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  33.64 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>