30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0485 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  100 
 
 		 315 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  45.42 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  47.11 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  44.05 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  34.72 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  32.92 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  33.22 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.92 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  34.36 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  31.77 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  29.37 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30.9 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  29.53 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  30.2 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  31.95 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  26.91 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  31.38 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  31.38 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  31.38 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  30.13 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  30.13 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  30.13 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.64 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.57 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.03 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  27.82 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  30 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  31.01 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.33 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  25.49 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>