31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2900 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  100 
 
 		 309 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  57.04 
 
 		 295 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  47.11 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  38.7 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  38.79 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  31.4 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  34.6 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  33.03 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  28.02 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.15 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  30.88 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  31.94 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  31.94 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  31.94 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  30.04 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  31.46 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  30.49 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.19 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  28.11 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.1 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  26.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  26.14 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  29.47 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  23.03 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  26.87 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  38.95 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  26.69 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  28.82 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>