44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5745 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  84.86 
 
 
283 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  68.55 
 
 
313 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  68.55 
 
 
313 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  68.55 
 
 
313 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  46.21 
 
 
293 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  47.74 
 
 
292 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  46.06 
 
 
341 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  46.06 
 
 
341 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  46.06 
 
 
341 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  46.15 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  35.21 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  40 
 
 
286 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  31.72 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  37.6 
 
 
285 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.66 
 
 
335 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  37.22 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  33.02 
 
 
315 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  31.6 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  36.02 
 
 
309 aa  89  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  29.33 
 
 
290 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  48.28 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  35.19 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  31.77 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  37.2 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  31.12 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  31.17 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  28.62 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  27.76 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.52 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  29.53 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.13 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.92 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.85 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  27.37 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  26.02 
 
 
370 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1331  hypothetical protein  28.28 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.453117  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  28 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  29.26 
 
 
294 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  29.64 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02218  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07070)  26.38 
 
 
770 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  25.97 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
800 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>