17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0609 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  36.46 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  31.86 
 
 
348 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  33.56 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 
280 aa  89.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  33.46 
 
 
322 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  32.89 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  35.59 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  34.87 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  34.44 
 
 
317 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  40.35 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  31.18 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  32.18 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  32.18 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  32.18 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  28.46 
 
 
370 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  28.73 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>