15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5195 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  618  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  61.27 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  56.7 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  32.84 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  38.01 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  33.21 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  32.91 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  33.85 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  26.86 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  31.93 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  34.27 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>