14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4102 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  598  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  87.31 
 
 
318 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  56.7 
 
 
322 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  40.69 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  40.69 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  40.69 
 
 
286 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  34.09 
 
 
294 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  38.01 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  34.17 
 
 
282 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  34.23 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  28.94 
 
 
348 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  32.16 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  28.11 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>