18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1393 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  100 
 
 		 294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  38.81 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  38.94 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  41.55 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  36.46 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  32.84 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  38.46 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  33.79 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  33.22 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  25.86 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  27.82 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  28.16 
 
 		 336 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  27.15 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  26.24 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  26.24 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  26.24 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>