20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3359 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  100 
 
 		 301 aa  551  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  42.47 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  37.46 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  37.7 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  40.58 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  35.86 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  39.9 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  39.85 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  40.14 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  35.17 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  28.39 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  32.87 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  32.87 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  32.87 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  26.26 
 
 		 309 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  30.42 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  29.31 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  32.34 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>