38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2518 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  529  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  38.87 
 
 
309 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  38.24 
 
 
283 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  41.2 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  41.2 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  41.2 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  34.57 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  38.53 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  35.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  35.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  35.66 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  31.29 
 
 
295 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  39.04 
 
 
285 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  32.84 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.78 
 
 
301 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  34.8 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  35.65 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  33.81 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  31.67 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  33.46 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  29.01 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  35.74 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  31.9 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  32.8 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.53 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  41.71 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.39 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  29.88 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  31.88 
 
 
425 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.38 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  27.96 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  29.54 
 
 
337 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  28.9 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  37.62 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  30.22 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  30.43 
 
 
308 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  28.74 
 
 
327 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>