29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2312 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  100 
 
 		 295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  56.57 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  45.34 
 
 		 315 aa  185  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  40.45 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  32.77 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  29.75 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  34.29 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  34.29 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  34.29 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  33.49 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  27.92 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  34.89 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  28.72 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  34.71 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.61 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.18 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  28.37 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  30.12 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  30.12 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  30.12 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  28.7 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  27.37 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  27.31 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  25.21 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  31.02 
 
 		 425 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  26.21 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.33 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>