38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2206 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  71.93 
 
 
293 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  73.72 
 
 
292 aa  299  6e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  59.05 
 
 
301 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  45.91 
 
 
309 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  45.32 
 
 
283 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  44.76 
 
 
313 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  37.36 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  36.48 
 
 
286 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  32.06 
 
 
335 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  37.96 
 
 
285 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  31.58 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  32.55 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  32.09 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  33.2 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  35.19 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  32.6 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  28.18 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.78 
 
 
290 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.57 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  35.71 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  26.5 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.49 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  32.16 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.24 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  29.93 
 
 
278 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  30.86 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  29.5 
 
 
295 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  25.11 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  28.88 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  26.77 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.99 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>