41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2299 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  41.26 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  36.52 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  37.15 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  36.33 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  38.93 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  38.93 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  38.93 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  38.03 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  38.78 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  35.32 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  33.59 
 
 		 335 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  33.68 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  32.43 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  32.56 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  41.53 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  35.41 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  35.48 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  31.32 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  31.63 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  30.36 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  31.02 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  33.75 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  26.85 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  45 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  41.94 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.52 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  36.68 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.97 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  28.19 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.02 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  31.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  31.99 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  27.6 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  26.83 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 800 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3831  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  28.34 
 
 		 370 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  28.05 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>