16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6654 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0226  hypothetical protein  70.8 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  30.52 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  32.16 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3712  hypothetical protein  27.24 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  25.96 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  40 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  25 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  24.81 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  26.67 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  23.7 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  28.85 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  24.3 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  26.46 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  43.94 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  26.1 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>