40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2309 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  47.73 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  47.27 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  48.05 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  49.19 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  49.19 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  49.19 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  48.39 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  44.75 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  44.75 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  44.75 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  41.92 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  43.98 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  39.15 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  35.86 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  33.8 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  37.54 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  37.77 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  33.74 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  34.48 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  34.04 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  38.55 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  34.95 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  33.8 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  30.88 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  35.66 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  36.21 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  31.87 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  33.6 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  31.82 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.57 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  30.77 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  30.12 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.01 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 800 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  30.74 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  26.95 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  26.67 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  29.36 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>