32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2388 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  38.27 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  37.2 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  34.76 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  31.2 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  33.9 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  33.46 
 
 		 313 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  33.46 
 
 		 313 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  33.46 
 
 		 313 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  33.49 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  33.2 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  35.98 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  35.98 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  35.98 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  31.32 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  32.93 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  31.47 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  40.58 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  29.51 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  30.65 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  32.89 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  35.65 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  31.85 
 
 		 276 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  29.68 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  29.67 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  26.7 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  30.92 
 
 		 301 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  31 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  32.07 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  37.97 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  27.88 
 
 		 302 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>