33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0579 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  62.28 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  45.62 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  37.63 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  41.79 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  39.19 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  39.48 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  37.45 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  31.46 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  28.98 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  30.38 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  34.24 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.23 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  29.36 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  29.36 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  29.36 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  35.13 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  28.63 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  28.27 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  30.83 
 
 		 302 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  35.08 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  44.26 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  28.63 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  25.52 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  26.51 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  25.88 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  25.66 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  25.17 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.64 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>