30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2167 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  50.2 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  45.62 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  36.39 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  34.38 
 
 
287 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  39.02 
 
 
276 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  30.41 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  37.09 
 
 
278 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  32.09 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  31.22 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  28.74 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  28.74 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
800 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  28.74 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29344  predicted protein  27.05 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.08 
 
 
293 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  29.18 
 
 
335 aa  58.9  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  29.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  30.67 
 
 
286 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  29.96 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  29.33 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  27.91 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  28.17 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  30.52 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3712  hypothetical protein  32.47 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>