31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2256 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  62.28 
 
 
337 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  46.6 
 
 
310 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  41.03 
 
 
336 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  35.91 
 
 
290 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  38.49 
 
 
278 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  38.78 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  35.45 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  33.75 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  29.79 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  28.87 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  31.21 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  29.3 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  29.3 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  29.3 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  31.3 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
800 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  33.56 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  28.75 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  28.75 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  28.75 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  28.18 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  27.97 
 
 
295 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  28.77 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  41.41 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  27.17 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  28.15 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  27.27 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  29.37 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  29.08 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04810  hypothetical protein  28.36 
 
 
628 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>