34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1906 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  44.85 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  47.43 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  39.85 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  38.32 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  37.23 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  40.73 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  36.3 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  30.96 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  35.56 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  34.35 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  33.06 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.7 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 		 800 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  31.02 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  31.7 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  29.9 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  34.69 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  32.41 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  32.91 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  29.53 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  50.57 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  29.35 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  29.2 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  29.96 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  28.33 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.18 
 
 		 335 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  30.2 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  30.2 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  30.2 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  32.67 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  28.77 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>