35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3964 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  77.9 
 
 
292 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  72.98 
 
 
341 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  72.98 
 
 
341 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  72.98 
 
 
341 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  53.81 
 
 
301 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  46.59 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  44.91 
 
 
283 aa  185  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  45.06 
 
 
313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  45.06 
 
 
313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  45.06 
 
 
313 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  35.07 
 
 
291 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  40.58 
 
 
285 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  34.87 
 
 
286 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  48.15 
 
 
305 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  32.06 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  31.92 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  31.96 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  31.6 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  31.41 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  33.21 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  33.03 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  31.49 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.57 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  33.33 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  32.34 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  31.2 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  34 
 
 
425 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.66 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  25.34 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  27.2 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  26.92 
 
 
276 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  29.06 
 
 
326 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  29.52 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>