35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2432 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  77.32 
 
 
293 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  73.39 
 
 
341 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  73.39 
 
 
341 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  73.39 
 
 
341 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  56.17 
 
 
301 aa  205  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  47.33 
 
 
309 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  44.81 
 
 
283 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  45.7 
 
 
313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  45.7 
 
 
313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  45.7 
 
 
313 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  38.77 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  38.87 
 
 
285 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  49.17 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  35 
 
 
286 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  32.44 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.67 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  30.82 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  30.85 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  31.91 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  31.47 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  26.56 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  32.3 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  32.59 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  38.28 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  29.93 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  32.95 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  30.5 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.35 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.96 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  29.37 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  25.58 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  39.68 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2471  hypothetical protein  31.25 
 
 
300 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>