39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5228 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  68.37 
 
 
309 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  68.75 
 
 
283 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  44.12 
 
 
293 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  44.35 
 
 
341 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  44.35 
 
 
341 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  44.35 
 
 
341 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  45.41 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  41.35 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  41.3 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  36.86 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  32.27 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  30.1 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  34.51 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2309  hypothetical protein  44.96 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  29.47 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  26.71 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  27.59 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  33.8 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4782  integral membrane protein  32.88 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  31.97 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  30.1 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  29.96 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0352  hypothetical protein  26.98 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7786  hypothetical protein  29.23 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.525818  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0579  hypothetical protein  28.98 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  28.67 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  29.47 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1380  integral membrane protein  24.32 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000169517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1344  integral membrane protein  28.1 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2907  hypothetical protein  27.37 
 
 
295 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.068579 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02218  DUF803 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07070)  26.5 
 
 
770 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.347502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6654  hypothetical protein  24.22 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  26.92 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.26 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>