28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16030  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2312  putative integral membrane protein  42.16 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0485  putative integral membrane protein  43.37 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2900  putative integral membrane protein  38.7 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1077  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1556  hypothetical protein  28.48 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  28.12 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3964  hypothetical protein  32.91 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3904  hypothetical protein  30.98 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1955  integral membrane protein  30.57 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2518  hypothetical protein  32.86 
 
 		 286 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08000  hypothetical protein  27.74 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2299  hypothetical protein  30.43 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5520  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.810487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5228  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.543825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5139  hypothetical protein  27.13 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1906  hypothetical protein  29.64 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2432  hypothetical protein  32.16 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2147  hypothetical protein  51.47 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2206  hypothetical protein  51.47 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.0990909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2160  hypothetical protein  51.47 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.274078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3513  integral membrane protein  29.19 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205394  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4398  hypothetical protein  26.46 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0944332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2256  hypothetical protein  27.94 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2167  hypothetical protein  30.15 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12742  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  39.24 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2702  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2388  hypothetical protein  29.24 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0574491  normal  0.0197415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>